Es ist den Sicherheitsdiensten ein Bedürfnis, das Lösen der Parkierberechtigungen am Bahnhof kundenfreundlicher zu gestalten, sodass dieses nur noch über einen Anbieter gelöst werden kann. Da die Stadt Amriswil den SBB für die auf der Südseite entfallenden Parkplätze als Ausgleich Parkplätze auf der Nordseite abtreten muss, wurde mit den Verantwortlichen der SBB vereinbart, dass künftig sämtliche Parkplätze am Bahnhof (Kurzzeitparkplätze Südseite und Langzeitparkplätze Nordseite) durch die SBB bewirtschaftet und kontrolliert werden. Bei den SBB erfolgt das Bezahlen der Parkplatzgebühren über die SBB-eigene App «P+Rail». Die Konzernleitung der SBB hat entschieden, dass gesamtschweizerisch keine Parkuhren mehr auf P+Rail Parkplätzen betrieben werden. So werden auch am Bahnhof Amriswil künftig keine Parkuhren mehr zur Verfügung stehen. Die Umstellung soll per 1. Mai 2025 erfolgen. Während der ersten Bauphase ab 5. Mai 2025 werden Kurzzeitparkplätze im südwestlichen Bereich des Bahnhofs aufrechterhalten, bis die neu angelegten Kurzzeitparkplätze im südöstlichen Bereich erstellt sind und genutzt werden können. Somit bleiben rund 14 Parkplätze für den Personenumschlag / Taxi und für Kunden der Geschäfte am Bahnhof erhalten (Im Plan rot markiert).